Domuz sirkovirüsü, domuzları enfekte eden bir virüstür ve 2026 itibarıyla bilinen en küçük virüslerden biridir. Parçacıkları yaklaşık 17 nanometre çapındadır; bir nanometre, bir metrenin milyarda biridir. Bu genişlik, virüsün DNA’sını barındıran küçücük protein topunun çapıdır.

Boyut

Her parçacık, kapsit denen, dış zarfı olmayan bir protein kabuğudur. Kapsit, tek bir proteinin 60 kopyasından oluşur ve bu kopyalar beşerli 12 küme halinde gruplanmıştır. Bu düzen kapsite, 20 üçgen yüzlü bir şekil olan ikosahedronun simetrisini verir. Kabuk yaklaşık 2,5 nanometre kalınlığındadır.

Yayımlanmış ölçümler yaklaşık 15 ile 25 nanometre arasında değişir. 2019’da virüsü saflaştıran araştırmacılar, elektron mikroskobu görüntülerinde yaklaşık 17 nanometre çapında parçacıklar ölçtü. 2003’te yapılan bir çalışma, donmuş parçacıkların görüntülerinden üç boyutlu bir model oluşturdu ve hafifçe yükselmiş protein kümelerinin uçlarına kadar yaklaşık 20,5 nanometre ölçtü. Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV), domuz sirkovirüsleri ve papağanlarda görülen, onlarla akraba bir virüs için 15–25 nanometre değerini verir.

Boyut karşılaştırmaları

• Yaklaşık 42 nanometre çapındaki bir hepatit B virüsü, bir domuz sirkovirüsünden yaklaşık 2,5 kat daha geniştir ve hacmi, bir domuz sirkovirüsünün hacminin yaklaşık 15 katıdır.
• Bir domuz sirkovirüsü, bir hücre zarındaki fosfolipid çift katmanının kalınlığının yaklaşık üç buçuk katı genişliğinde, 2 nanometre genişliğindeki DNA çift sarmalının ise yaklaşık 8,5 katı genişliğindedir.
• Yan yana dizilen yaklaşık 5.000 domuz sirkovirüsü, bir insan saçının kalınlığını baştan başa kaplardı; saçın kalınlığı 80.000–100.000 nanometredir.
• Bir domuz sirkovirüsü, 1,7 metre boyunda bir insan büyüklüğüne büyütülse, bir insan saçı 8–10 kilometre kalınlığında olurdu.

DNA ve ad

Kapsitin içinde, yalnızca tek şeritli, halka biçiminde bir DNA bulunur; bu DNA, PCV1 denen tipte 1.759 baz, PCV2’de ise 1.768 baz uzunluğundadır. Virüse adını veren, bu dairesel DNA’dır: “circo”, İngilizce “circular” (dairesel) sözcüğünden gelir.

DNA iki ana gen taşır. Biri, DNA’nın kopyalanmasını başlatmak için gereken bir proteini, öbürü kapsit proteinini üretir. 2026 itibarıyla ICTV, PCV1 ve PCV2’nin genomlarını, memeli hücrelerinde kendi başına çoğaldığı gösterilmiş virüsler arasındaki en küçük genomlar olarak tanımlıyor.

Domuzlarda hastalık

Doğal enfeksiyonlar, yaban domuzları dahil yalnızca domuzlarla sınırlı görünüyor. Virüs çoğunlukla, domuzlar enfekte dışkı kalıntılarını yuttuğunda yayılıyor. PCV1 herhangi bir hastalıkla ilişkilendirilmemiştir. PCV2, 8–16 haftalık domuz yavrularında görülen, kilo kaybı, solunum güçlüğü, sarılık, şişmiş lenf düğümleri ve ishalle seyreden zayıflatıcı bir hastalığın başlıca nedenlerinden biridir. Hastalık, domuzlar aşılanarak kontrol altına alınabilir.

Parçacıkları yok etmek zordur. PCV1, pH 3 asidine, 15 dakika boyunca 70°C’ye ısıtılmaya ve kloroform gibi çözücülere dayanır.

Kaynaklar

• Genus: Circovirus. International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV Report.
• Conformational Changes and Nuclear Entry of Porcine Circovirus without Disassembly. Wang et al., Journal of Virology, 2019.
• Comparison of the Structures of Three Circoviruses: Chicken Anemia Virus, Porcine Circovirus Type 2, and Beak and Feather Disease Virus. Crowther et al., Journal of Virology, 2003.
• The 2.3-Angstrom Structure of Porcine Circovirus 2. Khayat et al., Journal of Virology, 2011.
• Hepatitis B Virus Biology. Seeger and Mason, Microbiology and Molecular Biology Reviews, 2000.
• Structure of Lipid Bilayers. Nagle and Tristram-Nagle, Biochimica et Biophysica Acta, 2000.
• DNA Structure and Sequencing. In Biology 2e, 2nd edition. OpenStax, 2018.
• Just How Small Is "Nano"?. National Nanotechnology Initiative.