咖啡豆是咖啡植株的种子。咖啡豆成对生长在一种叫做咖啡樱桃的小果实里，经过晾晒、烘焙和研磨后就成为咖啡。图中所示的烘焙咖啡豆长 1 厘米。一项大型研究显示，阿拉比卡生豆平均长 9.6 毫米，宽 6.7 毫米，厚 3.7 毫米。

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上述数据来自一项研究，该研究对秘鲁国家咖啡种质资源库中并排种植的 150 个阿拉比卡品种进行了测量。这些品种的生豆长度在 7.9–13.0 毫米之间，宽度在 5.9–8.2 毫米之间，平均单粒重 0.16 克。

咖啡的分级部分依据豆粒大小，检验方式用的是带孔筛网而不是直尺。筛孔大小以六十四分之一英寸为单位，分级员会记录某个筛网筛不下去（即被截留）的咖啡豆比例。以埃塞俄比亚的分级体系为例，14 号筛的孔径为 5.6 毫米，一批咖啡豆中必须有超过 85% 被这种筛网截留。

豆形也因物种而异。阿拉比卡豆更扁更长；另一大主要咖啡物种罗布斯塔的豆则更小更圆。

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咖啡树种下三到四年后开始结果。成熟的咖啡樱桃会变成深红色或紫色。薄薄的果皮下是香甜多汁的果肉，果肉里面每粒豆都裹着一层叫做羊皮层的薄膜和一层银皮。在秘鲁那项研究中，带着羊皮层的咖啡豆平均长 12 毫米，比去掉羊皮层的裸豆长 2.4 毫米。

大多数咖啡樱桃里有两粒豆。在世界咖啡产量中，大约 5% 的咖啡樱桃只含一粒豆，称为圆豆。果农去除果皮和果肉的方式有两种：一种是把整颗咖啡樱桃晒干后再脱壳，另一种是先剥去果肉，再把咖啡豆晒干。

人们喝的咖啡几乎全部来自这两个物种。根据国际咖啡组织 2026 年 8 月发布的《咖啡市场报告》，阿拉比卡约占世界产量的 57%，罗布斯塔约占 43%。罗布斯塔咖啡豆的咖啡因含量比阿拉比卡高 50%–60%。

生豆放进烘焙机后会不断翻动，以免烤焦。当豆子内部温度达到约 200 °C 时，颜色开始变成褐色。豆子内部一种叫咖啡油（caffeol）的芳香油脂开始渗出，产生人们熟悉的咖啡风味和香气。